سامانه مدیریت نشریات علمی دانشگاه علوم پزشکی مشهد

فرناد, مرصع سادات, ممتاز, حسن, تدین, کیوان, مصوری, نادر, خسروی, یحیی. (1403). بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بیماران مبتلا به سل در کرج، ایران. , 67(2), 399-408. doi: 10.22038/mjms.2023.69504.4124
مرصع سادات فرناد; حسن ممتاز; کیوان تدین; نادر مصوری; یحیی خسروی. "بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بیماران مبتلا به سل در کرج، ایران". , 67, 2, 1403, 399-408. doi: 10.22038/mjms.2023.69504.4124
فرناد, مرصع سادات, ممتاز, حسن, تدین, کیوان, مصوری, نادر, خسروی, یحیی. (1403). 'بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بیماران مبتلا به سل در کرج، ایران', , 67(2), pp. 399-408. doi: 10.22038/mjms.2023.69504.4124
فرناد, مرصع سادات, ممتاز, حسن, تدین, کیوان, مصوری, نادر, خسروی, یحیی. بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بیماران مبتلا به سل در کرج، ایران. , 1403; 67(2): 399-408. doi: 10.22038/mjms.2023.69504.4124

بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بیماران مبتلا به سل در کرج، ایران

مجله دانشکده پزشکی دانشگاه علوم پزشکی مشهد
مقاله 2، دوره 67، شماره 2، خرداد و تیر 1403، صفحه 399-408    اصل مقاله (1.59 M)
نوع مقاله: مقاله پژوهشی
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22038/mjms.2023.69504.4124
نویسندگان
مرصع سادات فرناد1؛ حسن ممتاز* 2؛ کیوان تدین3؛ نادر مصوری4؛ یحیی خسروی5
1گروه میکروبیولوژی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران
2گروه میکروب شناسی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد
3گروه میکروبیولوژی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران. بخش تولید توبرکولین و مالئین، موسسه تحقیقات و سرم سازی کرج، کرج، ایران.
4بخش تولید توبرکولین و مالئین، موسسه تحقیقات و سرم سازی کرج، کرج، ایران
5گروه بهداشت حرفه‌ای، دانشکده بهداشت، مرکز تحقیقات بهداشت، ایمنی و محیط، دانشگاه علوم پزشکی البرز، کرج، ایران
چکیده
سابقه و هدف: سل معضلی قدیمی است که هم اکنون به عنوان چالشی جدید مطرح است. مطالعه حاضر با هدف بررسی تنوع ژنتیکی سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس جدا شده از بیماران مبتلا به سل در کرج، ایران انجام شد.
مواد و روش ها: هفده جدایه مایکوباکتریوم توبرکلوزیس از سال 2012 تا 2013 جمع‌آوری شد و تحت آنالیز پلی‌مورفیسم طول قطعه محدود IS6110 (IS6110-RFLP) قرار گرفتند. از نظر جمعیت شناختی، 6 زن و 14 مرد دارای تابعیت ایرانی در این مطالعه وارد شدند.
نتایج: 16 نوع ژنتیکی مختلف پس از هضم آنزیمی و تجزیه و تحلیل RFLP به دست آمد. تعداد کپی IS6110 در هر ایزوله از 0 تا 12 متغیر بود. اکثر ایزوله ها (66%) دارای اعداد کپی بین 6 تا 12 بودند. هر ایزوله دارای 6.9 کپی از نشانگر IS6110 بود. 9 جدایه دارای 10 تا 12 نسخه از نشانگر IS6110، 5 ایزوله دارای 6 تا 10 نسخه، و 2 ایزوله دیگر دارای نسخه های کمتر از 6 بودند. هیچ نسخه ای از IS6110 در بین 4 ایزوله یافت نشد. هیچ رابطه ای بین جنسیت و تعداد کپی یافت نشد.
نتیجه گیری: تنوع ژنتیکی بالای موجود در جدایه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ممکن است منابع مختلف عفونت و اهمیت ظهور مجدد سل را نشان دهد.با این حال، بررسی های بیشتر باید برای ارزیابی سایر جنبه های اپیدمیولوژیک مولکولی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس در ایران انجام شود.
کلیدواژه‌ها
مایکوباکتریوم توبرکلوزیس؛ تنوع ژنتیکی؛ IS6110-RFLP؛ ایران
مراجع
  1. World Health Organization (WHO). Global Tuberculosis report. WHO 2020.
  2. World Health Organization (WHO). Global tuberculosis control. WHO 2011.
  3. Kazerooni PA, Khazaei Z, Mousavi M, Khazaei S, Sohrabivafa M, Dehghani SL, Adineh HA, Delam H, Nejat M, Behzadi B, Esfahani MV. Prevalence of human immunodeficiency virus and tuberculosis among homeless individuals. Immunopathologia Persa. 2018;4(1):4.
  4. Ahmad S, Majid Z, Mehdi M, Mubarak M. Cerebral salt wasting syndrome due to tuberculous meningitis; a case report. Journal of renal injury prevention. 2016;5(1):53.
  5. Balwani MR, Kute VB, Shah PR, Wakhare P, Trivedi HL. Secondary renal amyloidosis in a patient of pulmonary tuberculosis and common variable immunodeficiency. Journal of nephropharmacology. 2015;4(2):69.
  6. Makarov V, Lechartier B, Zhang M, Neres J, van der Sar AM, Raadsen SA, Hartkoorn RC, Ryabova OB, Vocat A, Decosterd LA, Widmer N. Towards a new combination therapy for tuberculosis with next generation benzothiazinones. EMBO molecular medicine. 2014 Mar;6(3):372-83.
  7. Brown TS, Eldholm V, Brynildsrud O, Osnes M, Stennis N, Stimson J, Colijn C, Alexandru S, Noroc E, Ciobanu N, Crudu V. Evolution and emergence of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis in Chisinau, Moldova. medRxiv. 2021 Jan 1.
  8. Fox GJ, Schaaf HS, Mandalakas A, Chiappini E, Zumla A, Marais BJ. Preventing the spread of multidrug-resistant tuberculosis and protecting contacts of infectious cases. Clinical Microbiology and Infection. 2017 Mar 1;23(3):147-53.
  9. Makki SS, Ghorbani F, Najafizadeh K, Shafaghi S, Reza H, Vishteh K. Assessment of diagnostic value of different methods (culture, PCR and biopsy) for the diagnosis of tuberculosis in patients with bronchial anthracosis. Immunopathologia Persa. 2020 May 6;6(2):e24-.
  10. Zahedi Bialvaei A, Asgharzadeh M, Aghazadeh M, Nourazarian M, Samadi Kafil H. Challenges of Tuberculosis in Iran, Jundishapur J Microbiol. 2017 ; 10(3):e37866.
  11. Almeida SM, Malaspina AC, Leite CQ, Saad MH. Usefulness of 3'-5'IS6110-RFLP genotyping and spoligotyping of Mycobacterium tuberculosis isolated in a tertiary hospital: a retrospective study detecting unsuspected epidemiological events. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo. 2019;61.
  12. Peres RL, Vinhas SA, Ribeiro FK, Palaci M, do Prado TN, Reis-Santos B, Zandonade E, Suffys PN, Golub JE, Riley LW, Maciel EL. Risk factors associated with cluster size of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) of different RFLP lineages in Brazil. BMC infectious diseases. 2018 Dec;18(1):1-0.
  13. Ansarin K, Sahebi L, Aftabi Y, Khalili M, Seyyedi M. Comparing IS6110‐RFLP, PGRS‐RFLP and IS6110‐Mtb1/Mtb2 PCR methods for genotyping of Mycobacterium tuberculosis isolates. Journal of applied microbiology. 2020 Oct;129(4):1062-70.
  14. Farnad MS, Momtaz H, Mosavari N, Khosravi Y, Tadayon K. Insight into population structure of Mycobacterium tuberculosis isolates in the multiethnic province of Alborz, Iran. Iranian Journal of Microbiology. 2021 Feb 10;13(1):58-64.
  15. Huard RC, de Oliveira Lazzarini LC, Butler WR, van Soolingen D, Ho JL. PCR-based method to differentiate the subspecies of the Mycobacterium tuberculosis complex on the basis of genomic deletions. J Clin Microbiol 2003;41:1637-1650.
  16. McHugh TD, Gillespie SH. Nonrandom association of IS6110 and Mycobacterium tuberculosis: implications for molecular epidemiological studies. J Clin Microbiol 1998;36:1410-1413.
  17. Van Soolingen D, Hermans P, De Haas P, Soll D, Van Embden J. Occurrence and stability of insertion sequences in Mycobacterium tuberculosiscomplex strains: evaluation of an insertion sequence-dependent DNA polymorphism as a tool in the epidemiology of tuberculosis. J Clin Microbiol 1991; 29:2578-2586.
  18. Abdolmaleki Z, Mashak Z, Dehkordi FS. Phenotypic and genotypic characterization of antibiotic resistance in the methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains isolated from hospital cockroaches. Antimicrobial Resistance & Infection Control. 2019 Dec;8(1):1-4.
  19. Ranjbar R, Farsani FY, Dehkordi FS. Phenotypic analysis of antibiotic resistance and genotypic study of the vacA, cagA, iceA, oipA and babA genotypes of the Helicobacter pylori strains isolated from raw milk. Antimicrobial Resistance & Infection Control. 2018 Dec;7(1):1-4.
  20. Van Soolingen D, Qian L, De Haas P, Douglas JT, Traore H, Portaels F, et al. Predominance of a single genotype of Mycobacterium tuberculosisin countries of east Asia. J Clin Microbiol 1995; 33:3234-3238.
  21. Ramazanzadeh R, Shakib P, Rouhi S, Mohammadi B, Mohajeri P, Borji S. Molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis isolates in Iran using spoligotyping. New Microbes and New Infections. 2020 Nov 1;38:100767.
  22. Pourostadi M, Rashedi J, Poor BM, Kafil HS, Kazemi A, Asgharzadeh M. Tuberculosis control and role of molecular epidemiology studies in Iran: a systematic review. Tanaffos. 2017;16(3):190.
  23. Sahebi L, Ansarin K, Hoffner S, Farajnia S, Seyyedi M, Khalili M, Monfaredan A. Molecular Epidemiology of Mycobacterium Tuberculosis Strains in the North‑West and West of Iran. Annals of medical and health sciences research. 2015;5(5):334-9.
  24. Munsiff SS, Bassoff T, Nivin B, Li J, Sharma A, Bifani P, Mathema B, Driscoll J, Kreiswirth BN. Molecular epidemiology of multidrug-resistant tuberculosis, New York City, 1995–1997. Emerging infectious diseases. 2002 Nov;8(11):1230.
  25. Jagielski T, Minias A, Van Ingen J, Rastogi N, Brzostek A, Żaczek A, Dziadek J. Methodological and clinical aspects of the molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis and other mycobacteria. Clinical microbiology reviews. 2016 Apr 1;29(2):239-90.
  26. Vluggen C, Soetaert K, Groenen G, Wanlin M, Spitaels M, Arrazola de Oñate W, Fauville-Dufaux M, Saegerman C, Mathys V. Molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis complex in Brussels, 2010–2013. PLoS One. 2017 Feb 21;12(2):e0172554.
  27. Chen L, Pang Y, Ma L, Yang H, Ru H, Yang X, Yan S, Jia M, Xu L. First insight into the molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis isolates from the minority enclaves of southwestern China. BioMed research international. 2017 May 17;2017.
  28. Verza M, Scheffer MC, Salvato RS, Schorner MA, Barazzetti FH, de Melo Machado H, Medeiros TF, Rovaris DB, Portugal I, Viveiros M, Perdigão J. Genomic epidemiology of Mycobacterium tuberculosis in Santa catarina, Southern Brazil. Scientific reports. 2020 Jul 30;10(1):1-1.
  29. Chisompola NK, Streicher EM, Muchemwa CM, Warren RM, Sampson SL. Molecular epidemiology of drug resistant Mycobacterium tuberculosis in Africa: a systematic review. BMC infectious diseases. 2020 Dec;20:1-6.
  30. Joseph BV, Soman S, Radhakrishnan I, Hill V, Dhanasooraj D, Kumar RA, Rastogi N, Mundayoor S. Molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis isolates from Kerala, India using IS6110-RFLP, spoligotyping and MIRU-VNTRs. Infection, genetics and evolution. 2013 Jun 1;16:157-64.
  31. Al-Hajoj S, Varghese B, Al-Habobe F, Shoukri MM, Mulder A, van Soolingen D. Current trends of Mycobacterium tuberculosis molecular epidemiology in Saudi Arabia and associated demographical factors. Infection, Genetics and Evolution. 2013 Jun 1;16:362-8.
  32. Mokrousov I. Molecular structure of Mycobacterium tuberculosis population in Russia and its interaction with neighboring countries. International journal of mycobacteriology. 2015 Mar 1;4:56-7.
  33. Doroudchi M, Kremer K, Basiri EA, Kadivar MR, Van Soolingen D, Ghaderi AA. IS6110-RFLP and spoligotyping of Mycobacterium tuberculosis isolates in Iran. Scandinavian journal of infectious diseases. 2000 Jan 1;32(6):663-8.
  34. Roychowdhury T, Mandal S, Bhattacharya A. Analysis of IS 6110 insertion sites provide a glimpse into genome evolution of Mycobacterium tuberculosis. Scientific reports. 2015 Jul 28;5(1):1-0.
  35. Howard ST, Oughton MT, Haddad A, Johnson WM. Absence of the genetic marker IS6110 from a strain of Mycobacterium tuberculosis isolated in Ontario. Canadian Journal of Infectious Diseases. 1998 Jan 1;9(1):48-53.
  36. Steensels D, Fauville-Dufaux M, Boie J, De Beenhouwer H. Failure of PCR-Based IS6110 analysis to detect vertebral spondylodiscitis caused by Mycobacterium bovis. Journal of clinical microbiology. 2013 Jan 1;51(1):366-8.
  37. Huyen MN, Tiemersma EW, Kremer K, de Haas P, Lan NT, Buu TN, Sola C, Cobelens FG, van Soolingen D. Characterisation of Mycobacterium tuberculosis isolates lacking IS6110 in Viet Nam. The International journal of tuberculosis and lung disease. 2013 Nov 1;17(11):1479-85.
  38. Millán-Lou MI, López-Calleja AI, Colmenarejo C, Lezcano MA, Vitoria MA, del Portillo P, Otal I, Martín C, Samper S. Global study of IS6110 in a successful Mycobacterium tuberculosis strain: clues for deciphering its behavior and for its rapid detection. Journal of clinical microbiology. 2013 Nov 1;51(11):3631-7.
  39. Zhou L, Ma C, Xiao T, Li M, Liu H, Zhao X, Wan K, Wang R. A new single gene differential biomarker for Mycobacterium tuberculosis complex and non-tuberculosis mycobacteria. Frontiers in microbiology. 2019 Aug 13;10:1887.
  40. Asgharzadeh M, Khakpour M, Salehi TZ, Kafil HS. Use of mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem repeat typing to study Mycobacterium tuberculosis isolates from East Azarbaijan province of Iran. Pakistan journal of biological sciences: PJBS. 2007 Nov 1;10(21):3769-77.
  41. Rohani M, Farnia P, Nasab MN, Moniri R, Torfeh M, Amiri MM. Beijing genotype and other predominant Mycobacterium tuberculosis spoligotypes observed in Mashhad city, Iran. Indian journal of medical microbiology. 2009 Oct 1;27(4):306.
  42. Azimi T, Nasiri MJ, Zamani S, Hashemi A, Goudarzi H, Fooladi AA, Feizabadi MM, Fallah F. High genetic diversity among Mycobacterium tuberculosis strains in Tehran, Iran. Journal of clinical tuberculosis and other mycobacterial diseases. 2018 May 1;11:1-6.
  43. Soleimanpour S, Hamedi Asl D, Tadayon K, Farazi AA, Keshavarz R, Soleymani K, Seddighinia FS, Mosavari N. Extensive genetic diversity among clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis in central province of Iran. Tuberculosis research and treatment. 2014 Jan 1;2014.
  44. Vaziri F, Kohl TA, Ghajavand H, Kamakoli MK, Merker M, Hadifar S, Khanipour S, Fateh A, Masoumi M, Siadat SD, Niemann S. Genetic diversity of multi-and extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis Isolates in the capital of Iran, revealed by whole-genome sequencing. Journal of clinical microbiology. 2019 Jan 1;57(1).

Heidari F, Farnia P, Noroozi J, Majd A, Tajedin E, Masjedi MR, Velayati A. The rapid identification of atypical mycobacterium in pulmonary tuberculosis (ptb) patients: evaluation of qub3232 locus using the vntr method. J Adv Med Biomed Res. 2009;17(67):33-44.

آمار
تعداد مشاهده مقاله: 999
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 514